Im Planung, eine ziemlich große Anzahl von Bildern zu verarbeiten und möchte alle 5 aufeinander folgenden Bilder durchschnittlich sein. Meine Bilder werden als. dm4-Dateiformat gespeichert. Im Wesentlichen möchte ich eine einzelne gemittelte Bildausgabe für jede 5 Bilder produzieren, die ich speichern kann. So zum Beispiel, wenn ich 400 Bilder hätte, möchte ich 80 gemittelte Bilder erhalten, die die 400 Bilder darstellen würden. Im bewusst, dass theres die Running Z Projektor-Plugin aber es einen laufenden Durchschnitt und tut mir nicht die reduzierte Anzahl von Bildern Im suchen. Ist dies etwas, das schon einmal getan wurde Danke für die Hilfe gefragt Nov 6 14 um 17: 03Konvertiert ein Hypervolume zurück in einen Stapel von Scheiben. Erzeugt ein einzelnes Bild, das die Bilder eines Stapels enthält, der in einem Rasterformat angezeigt wird. Dies kann für visuelle Vergleiche einer Reihe von Bildern nützlich sein, die in einem Stapel gespeichert sind. In einem Dialogfenster können Sie den Vergrößerungsfaktor (Skalierungsfaktor) angeben, mit dem die Bilder kopiert werden, und das Layout des resultierenden Rasters (Spalten, Zeilen, erste Scheibe, letzte Scheibe, Inkrement) auswählen. Mit ImageJ 1.35m oder höher markieren Sie die Option Vordergrundfarbe verwenden, um Rahmen und Beschriftungen in die Vordergrundfarbe zu zeichnen und leere Bereiche mit der Hintergrundfarbe zu füllen. Verwenden Sie das Makro "Muffler-Werkzeug", um die Bilder in der Montage neu anzuordnen. Rekonstruiert eine oder mehrere orthogonale Slices durch das durch den aktuellen Stack repräsentierte Bildvolumen. Vor der Verwendung dieses Befehls erstellen Sie eine gerade Linie oder rechteckige Auswahl, um anzugeben, ob die Rekonstruktionen durchgeführt werden. In einem Dialogfenster können Sie den Z-Abstand (Verschiebung zwischen den Slices) des Quell-Volumes angeben. Mehrere Slices werden rekonstruiert und als Stack gespeichert, wenn Sie eine rechteckige Auswahl erstellen oder die Slice-Breite größer als eins setzen. Bilder werden erzeugt, indem jede Scheibe im Stapel entlang der Linie entnommen wird. Somit wird das erste Pixel in jeder Zeile des Ausgabebildes vom Anfang der Zeile und das letzte vom Ende genommen. In dem Fall, in dem die Scheibenbreite größer als eins ist, wird ein Stapel durch Verschieben der Zeile nach unten und nach links erzeugt, um zusätzliche Scheiben für den Ausgangsstapel zu erzeugen. Dieses Plugin und das ZProject-Plugin. Wurden von Patrick Kelly und Harvey Karten der Universität von Kalifornien, San Diego beigetragen. Projiziert einen Bildstapel entlang der Achse senkrecht zur Bildebene (die so genannte z-Achse). Es werden sechs verschiedene Projektionstypen unterstützt. Der ZProject-Befehl erstellt Bildnamen in der Form XXXstack, wobei XXX AVG, MAX, MIN, SUM, STD und MED ist und stack der Name des Stacks ist. Durchschnittliche Intensitätsprojektion gibt ein Bild aus, bei dem jedes Pixel eine durchschnittliche Intensität über alle Bilder im Stapel an einer entsprechenden Pixelposition speichert. Maximale Intensitätsprojektion (Max) erzeugt ein Ausgabebild, dessen Pixel den maximalen Wert über alle Bilder im Stapel an dem jeweiligen Pixelort enthalten. Minimale Intensitätsprojektion (Min) erzeugt ein Ausgabebild, dessen Pixel jeweils den minimalen Wert über alle Bilder im Stapel an der jeweiligen Pixelposition enthalten. Sum Slices erzeugt ein reelles Bild, das die Summe der Slices im Stack ist. Standardabweichung erzeugt ein reelles Bild, das die Standardabweichung der Scheiben enthält. Median erstellt ein Bild mit dem Medianwert der Slices. Erzeugt eine Animationssequenz durch Projektion durch einen rotierenden 3D-Datensatz auf eine Ebene. Jeder Rahmen in der Animationssequenz ist das Ergebnis der Projektion von einem anderen Betrachtungswinkel. Um dies zu veranschaulichen, stellen Sie sich ein Feld von parallelen Strahlen vor, die durch ein Volumen führen, das ein oder mehrere feste Objekte enthält und auf einen Bildschirm schlägt, der normal zu den Richtungen der Strahlen orientiert ist. Jeder Strahl projiziert einen Wert auf dem Bildschirm oder Projektionsebene, basierend auf den Werten der Punkte entlang seines Weges. Drei Methoden stehen zur Berechnung der Projektionen auf dieser Ebene zur Verfügung: Nächster Punkt, Hellster Punkt. Und Mittelwert. Die Wahl der Projektionsmethode und die Einstellungen der verschiedenen Visualisierungsparameter bestimmen, wie Oberflächenstrukturen und Innenstrukturen entstehen. Diese Routine wurde von Michael Castle und Janice Keller von der University of Michigan Mental Health Research Institute (MHRI) geschrieben. Bild einfügen Dialog Wählen Sie "Nächste Punktprojektion", um ein Bild der vom aktuellen Betrachtungswinkel sichtbaren Flächen zu erzeugen. An jedem Punkt in der Projektionsebene durchläuft ein Strahl senkrecht zur Ebene durch das Volumen. Der Wert des nächsten nicht transparenten Punktes, auf den der Strahl trifft, wird in dem Projektionsbild gespeichert. Brightest Point-Projektion untersucht Punkte entlang der Strahlen, projiziert den hellsten Punkt auf jedem Strahl begegnet. Dies zeigt die hellsten Objekte, wie Knochen in einer CT (Computertomographie) Studie. Mittelwertprojektion, eine Modifikation der hellsten Punktprojektion, summiert die Werte aller transparenten Punkte entlang jedes Strahls und projiziert ihren Mittelwert. Es erzeugt Bilder mit weicheren Kanten und einem geringeren Kontrast, kann aber nützlich sein, wenn man versucht, Objekte zu visualisieren, die in einer Struktur mit größerer Helligkeit (z. B. einem Schädel) enthalten sind. Slice Spacing ist das Intervall in Pixeln zwischen den Slices, aus denen die Lautstärke besteht. ImageJ projiziert das Volumen auf die Betrachtungsebene bei jedem Drehwinkel-Inkrement. Beginnend mit dem Volumen, das durch den Anfangswinkel gedreht wird und beendet, sobald die Lautstärke durch die Gesamtdrehung gedreht wurde. Die unteren und oberen Transparency-Bound-Parameter bestimmen die Transparenz der Strukturen im Volume. Projektion Berechnungen nicht berücksichtigen Punkte mit Werten kleiner als die untere Schwelle oder größer als die obere Schwelle. Das Festlegen dieser Grenzwerte erlaubt es, Hintergrundpunkte (die nicht zu irgendeiner Struktur gehören) unsichtbar zu machen. Indem Sie entsprechende Schwellenwerte einstellen, können Sie Schichten entfernen, die einigermaßen einheitliche und einzigartige Intensitätswerte aufweisen und innere Strukturen hervorheben (oder unsichtbar machen). Beachten Sie, dass Sie auch Bild / Anpassen / Threshold verwenden können, um die Transparenzgrenzen einzustellen. Manchmal ist die Lage von Strukturen in Bezug auf andere Strukturen in einem Volumen nicht klar. Der Opacity-Parameter erlaubt die Anzeige gewichteter Kombinationen der Nahpunktprojektion mit einer der beiden anderen Methoden, die dem Betrachter oft die Möglichkeit gibt, innere Strukturen durch lichtdurchlässige Außenflächen zu sehen. Um diese Funktion zu aktivieren, setzen Sie die Deckkraft auf einen Wert größer Null und wählen Sie entweder Mittelwert oder Hellpunktprojektion. Tiefenstimmungen können zur dreidimensionalen Qualität von Projektionsbildern beitragen, indem Perspektive auf projizierte Strukturen gegeben wird. Die Tiefen-Cueing-Parameter bestimmen, ob projizierte Punkte, die in der Nähe des Betrachters entstehen, heller erscheinen, während Punkte, die weiter entfernt sind, linear mit dem Abstand gedimmt werden. Der Kompromiss für diesen erhöhten Realismus besteht darin, dass Datenpunkte, die in einem Tiefenbild angezeigt werden, nicht mehr genaue densitometrische Werte besitzen. Zwei Arten von Tiefen-Cueing stehen zur Verfügung: Surface Depth-Cueing und Interior Depth-Cueing. Surface Depth-Cueing arbeitet nur an Nahpunkt-Projektionen und der Nahpunkt-Komponente anderer Projektionen mit Opazität eingeschaltet. Interieur Depth-Cueing arbeitet nur bei hellsten Punktprojektionen. Für beide Arten wird die Tiefeneinstellung ausgeschaltet, wenn sie auf Null gesetzt wird (dh 100 Intensitäten im Rückwärtsgang bis 100 Intensität vorne), und sie ist eingeschaltet, wenn sie auf 0ltn 100 (dh 100 n) der Intensität auf 100 Intensität eingestellt ist vor). Durch die unabhängige Tiefeneinstellung für Flächen (Nahpunkt) und Innenraum (hellster Punkt) können weitere Visualisierungsmöglichkeiten erreicht werden. Überprüfen Sie Interpolate, um einen temporären z-skalierten Stack zu erzeugen, mit dem die Projektionen erzeugt werden. Z-Skalierung eliminiert die Lücken, die in Projektionen von Volumina mit einem Schichtabstand von mehr als 1,0 Pixeln gesehen werden. Diese Option entspricht der Verwendung des Scale-Plugins aus dem TransformJ-Paket, um den Stack in der z-Dimension durch den Slice-Abstand (in Pixeln) zu skalieren. Dieses Kontrollkästchen wird ignoriert, wenn der Slice-Abstand kleiner oder gleich 1,0 Pixel ist. Gibt den ROI-Auswahl-Grauwert als Funktion der Slice-Nummer an. Benötigt eine Auswahl. Animiert den aktiven Stack durch wiederholtes Anzeigen seiner Segmente (Frames) in Folge. Verwenden Sie Stop Animation. Oder klicken Sie mit der Maus, um zu stoppen. Öffnen Sie das Dialogfeld Animationsoptionen, um die Animationsgeschwindigkeit festzulegen. Mehr als ein Stapel kann zu einem Zeitpunkt animiert werden. Als Abkürzung drücken Sie die Backslash-Taste (), um die Animation zu starten oder zu stoppen. Drücken Sie in ImageJ 1.38 und höher Alt und Backslash, um das Dialogfeld Animationsoptionen zu öffnen. Beendet die Animation des aktiven Stacks. Als Verknüpfung drücken Sie die Backslash-Taste. Verwenden Sie diesen Dialog, um die Animation Speed in Frames pro Sekunde einzustellen, stellen Sie First Frame und Last Frame (1.38 oder höher) ein oder aktivieren Sie die oszillierende Animation (Loop Back und Forth). In ImageJ 1.38 oder höher können Sie Alt und Backslash (alt) drücken, um diesen Dialog anzuzeigen. Gui / image / stacks. txt middot Zuletzt geändert: 2010/01/26 11:07 (extern) Grayscale Moving Average Auf diese Nachricht von Todd Johnson-4 In der Beschreibung sagt er, er will sich um einen Kreis um eine Uhr bewegen Zeit. Der Convolution-Filter in ImageJ würde ein Pixel auf einmal verschieben würde es nicht Ich denke, das würde nicht gut funktionieren, da die einzigen Pixel-Werte, die man wünschen würde diejenigen, wo der Kernel tatsächlich Linien mit den Kreisen wäre. Ich bin nicht sicher, welche Werte Sie versuchen, zu bekommen. Wollen Sie einen Durchschnitt für jede horizontale quotrowot, wo jede Zeile besteht aus zwei Reihen von Kreisen Oder wollen Sie eine Zahl für die erste Gruppe von 2x2 Kreise, eine andere Nummer für die zweite, etc So oder so, ich glaube, es ist ein Partikel-Analysator Die den mittleren Graustufenwert jedes Kreises finden und messen und in die Ergebnisse einfügen können. Dann wäre es einfach, es in eine Kalkulationstabelle und bekommen, was Zahlen Sie suchen. Sie könnten auch eine spezielle Faltungsfunktion schreiben, bei der jeder Schritt die Größe der Distanz zwischen den Kreisen war, aber das funktioniert nur, wenn Sie vor der Hand genau wissen, wo sich die Kreise in jedem Bild befinden, und ich denke, der Partikelanalysator wäre jedenfalls einfacher. Am 26/26/06, H. Gluender lthidden E-Mail gt schrieb: gt gtI bin neu bei ImageJ. Ich habe ein Bild von vielen Graustufen-Kreisen in der Nähe gt gttogether auf einem schwarzen Hintergrund. Id wie die durchschnittliche Graustufen über gt gta 2x2 Kreis-Array (rechteckige Fläche plus Hintergrund). Dann bewegen Sie die gt gtside einen Kreis und wiederholen, wobei ein gleitender Durchschnitt der durchschnittlichen gt gtgrayscale Werte entlang der horizontalen Achse. Dann verschieben Sie einen Kreis gt gtand erhalten einen anderen horizontalen Achsendatensatz, etc. Schließlich mögen gt gt gtobtain Graustufenwerte entlang der vertikalen Achse in der gleichen Methode. Gt gtWhat ist der einfachste Weg gt gt gtThanks, Todd Johnson gt gt gt gt Lieber Todd Johnson, gt gt, wenn ich Sie richtig verstehe, wollen Sie tun, was heißt Tiefpass GT-Filterung eines Bildes durch Falten es mit dem beschriebenen Kernel. Gt gt Dazu definieren Sie einfach den Kernel in quotProzess gt Filter gt gt Convolve. Klicken Sie auf OK. Das resultierende Bild besteht dann aus den gt-laufenden Durchschnitten, die Sie suchen. Gt gt HTH gt gt gt gt gt gt gt gt ltgluender. de gt gt
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